小昭寺位于拉薩城的東北部，八角街北約500米處，座西朝東，由庭院、神殿、門樓、釋迦牟尼像、屋面金頂和內外轉經回廊組成，總占地面積約4000平方米。寺廟取名“甲達熱木齊祖拉康”，意為“漢虎神變寺”。小昭寺是漢語稱謂；小，是與大昭寺相對應而言；昭，是藏語“覺臥”的音譯，意思是佛。寺內供有釋迦牟尼八歲等身赤金像及眾多的佛像和唐卡等。1962年被列為自治區重點文物保護單位。 

小昭寺主樓三層，底層分門庭、經堂、佛殿三部分，周圍是轉經廊道，廊壁上遍繪無量壽佛像。頂層是漢式金瓦，金光閃閃，凌空摩天，拉薩各個方位均能看到，蔚為壯觀。

小昭寺創建于公元七世紀中葉，香火延綿已逾千年。相傳文成公主入藏時帶了一尊釋迦牟尼十二歲等身赤金像，行至現在的小昭寺時，木車陷入沙地中。公主通過歷算，決定把釋迦牟尼佛像安放此處供奉，遂建小昭寺。這座寺廟由文成公主主持修建，與大昭寺同時開工，同時告竣，同時開光；大門朝東，以寄托這位公主對家鄉父母的思念。 

小昭寺主神殿原來主供文成公主從長安帶來的釋迦牟尼佛像，大昭寺主神殿原來主供尼泊爾公主從加德滿都帶來的釋迦牟尼佛像，后來兩座佛像換了位。根據五世達賴喇嘛所著的《大昭寺目錄》等書記載：小昭寺最早主供佛像是文成公主帶來的釋迦牟尼佛像。松贊干布逝世后，遵照文成公主的旨意，大昭寺和小昭寺釋迦牟尼佛像進行了對換，把尼泊爾公主帶來的釋迦牟尼佛像作為主圣供在小昭寺。 

著名的拉薩上密院，也設在小昭寺內，這是格魯派僧人研讀佛經頗有成績的喇嘛進一步深造、修習密乘的地方，上密院堪布兼任小昭寺主持。