各莫寺彩奪目的吉祥圖案。舉目望去，在藍天白云和雪山碧草的映襯下，寶塔顯的格外莊嚴神圣、華美壯觀。

大寶塔第一、二層佛殿中間上下貫通，正中為5米見方，封閉的方形壇柱，直貫二樓頂層，佛殿內供奉的佛像按照順時針方向依次是：南面的千手千眼觀音像、西面的文殊菩薩像、北面的綠度母像和東面的毗盧佛像；在這幾尊主要供奉的佛像周圍還供有上千尊度母像、108套大藏經以及方形壇柱內供藏的宗喀巴大師畫像、“緣悲經”各一億幅及各種陶土燒制的佛像3億尊。
寶塔第三層是大寶師尊殿，是各莫寺鎮寺之寶所在地，殿內正中央是格魯派創始人宗喀巴大師頂骨舍利的流金靈塔，據說在藏傳佛教寺廟里，只有兩座寺廟擁有宗喀巴大師的舍利，一座在今西藏，另一座就是各莫寺；整個靈塔被玻璃罩罩在里面，在靈塔四周分別供奉著宗喀巴師徒三尊像、覺仲三尊像、師君三尊像、八大清凈眷屬以及一至五世嘉木樣活佛像及各種文集。

第四層是寶塔的塔瓶位置，內中供奉從尼泊爾迎請的，高兩米有余的阿彌陀佛像，在阿彌陀佛像的左右兩邊是八大菩薩像，除此之外，塔瓶內的面壁上繪有精美的極樂凈土壁畫，體現出了信教徒們對西方極樂世界的向往。寶塔第五層是重疊鎏金的大方門也就是塔門位置，在這僅有5個平方的殿內主要供奉著宗喀巴師徒三尊像。塔門四周是護欄，朝覲者以及游人可以站在護欄以內的地方鳥瞰整個寺廟的全景。

寶塔第六層是平臥重疊的十三層法輪，內中供有從山西五臺山等地迎請來的七千余尊小佛像。

第七層是寶塔頂層，也就是塔尖，塔尖外部置有滴水檐和日月寶頂。

各莫寺大經堂，大經堂是僧侶們一心向佛、修身養性、集體頌經的地方，經堂外的壁畫上繪有瑪卿、西方極樂世界、四大天王（護國天王、增長天王、廣目天王、多聞天王）這是守護圣土東西南北四方的至尊天王、六道輪回圖（地獄道、餓鬼道、走獸道、人道、神道、天道），走進經堂大廳內是一個可容納近千人同時頌經的大型場所，經堂的半空中以及立柱上懸掛著100多幅唐卡，大經堂內壁畫。