瓦灰山景區屬省級自然保護區，保護區面積635平方公里、核心區面積200平方公里，這里風景優美，自然資源十公豐富，盛產蟲草、大黃、黃芪、黃苓、天麻等多種名貴中藥材，原始森林茂盛，主要有高山松、云南松、華山松、油松、鐵堅松、長苞冷杉、鮮皮冷杉等數十種，散生的云南紅豆杉、杉松、三尖松、連香樹等20余種屬珍稀樹種。

瓦灰山盛產蟲草、大黃、黃芪、黃苓、天麻等多種名貴中藥材。區內珍稀動物種類繁多，屬國家重點保護動物有大熊貓、水鹿、白唇鹿、短尾猴、狗熊、馬熊、綠尾紅雉、大腓胸鸚鵡、盤羊等幾十余種。

自然景觀有：瓦灰山祭龍壇、瓦灰山森林公園、瓦灰山紅水溝、瓦灰山黑海瀑布群(六瀑布，最低瀑布為20M，最高為70M、瓦灰山鳳凰坪、瓦灰山海子溝、瓦灰山鳳凰湖、瓦灰山彩色湖(四個、瓦灰山鳳凰坪海子、瓦灰山珍珠灘(中間—瀑布）、瓦灰山現代冰川、瓦灰山萬年積雪、瓦灰山冬季天然滑雪場、瓦灰山冬季天然溜冰場、瓦灰山草地瀑布。